ÉTUDIANTS

2022 - 2024

Gabriel Zavala

Candidat à la maîtrise
Département de chimie et sciences biomoléculaires 
Faculté des sciences
Université d'Ottawa

Superviseur:

Dr. Roberto Chica 

Projet:

Ingénierie d'un canal ionique à ligand activé par le glucose

Description:

Les canaux ioniques ligand-dépendants (CILDs) sont des protéines qui se lient à un substrat et permettent le flux ionique transmembranaire. Mon objectif principal est de combiner l'apprentissage automatique, avec le multi-state design ainsi que l'évolution dirigée pour créer un CILD activé par le glucose rivalisant l'efficacité du type sauvage. Associé à la recherche sur les cellules sécrétrices d'insuline, l'objectif est d'initier une nouvelle solution pour les patients diabétiques.

Loisirs:

Voyager, bière artisanale, jeux vidéo, natation, escalade sur blocs et escalade.

Ville Natale:

Monterrey, Mexico

Ilya Dementyev

Candidat à la maîtrise
Département de chimie et sciences biomoléculaires 
Faculté des sciences
Université d'Ottawa

Superviseur:

Dr. Roberto Chica 

Projet:

Utilisation du multi-state design et de simulations computationnelles haute performance pour améliorer l’efficacité catalytique d'une enzyme de novo

Description:

Développement et validation expérimentale d'algorithmes de conception d’une nouvelle génération d'enzymes.

Loisirs:

Concevoir des projets et des plugins dans Unreal Engine, faire de l'exercice, regarder Netflix, écouter de la musique et en créer.

Ville Natale:

Greater Toronto Area, Ontario, Canada. 


Megan-Faye Parker

Candidate à la maîtrise
Département de chimie
Université de Montréal

Superviseur:

Dre. Joelle Pelletier 

Projet:

Création de nouveaux substrats pour le marquage par transglutaminase par ingénierie des protéines

Description:

Les conjugués anticorps-médicament (CAM) utilisent la spécificité des anticorps pour diriger les médicaments vers leur cible, par exemple, les cellules cancéreuses. Ce projet utilise l’enzyme transglutaminase microbienne (TGm) pour conjuguer les résidus de glutamine exposés à la surface des anticorps à une charge en acides aminés. Le niveau de réactivité des différents résidus de glutamine varie pour des raisons inconnues, et le seul résidu de glutamine à la surface de l'anticorps IgG humain pour réagir avec la TGm est entravé par la glycosylation, qui est essentielle pour la stabilité et la solubilité de l'anticorps. Notre objectif est de créer de nouveaux sites réactifs sur l'anticorps glycosylé en substituant des résidus uniques exposés à la surface de la région du fragment cristallisant (Fc) par une glutamine, puis d'étudier la réactivité de chaque mutant pour la conjugaison par l'enzyme mTG. La synthèse de CAM glycosylés par la mTG pourrait conduire à des traitements du cancer ciblés avec une meilleure efficacité et moins d'effets secondaires.

Loisirs:

Je joue du piano, j'apprécie l'artisanat, le tricot, la couture, etc. Je suis également un grand passionné de culture geek (Harry Potter, Star Wars, Le Seigneur des Anneaux, etc.).

Ville Natale:

St-Eustache, Québec, Canada


Iain McDonald

Candidat à la maîtrise
Département de chimie
Faculté des sciences
Université de Waterloo

Superviseur:

Dr. Elizabeth Meiering

Projet:

Modifier rationnellement la stabilité cinétique des protéines grâce à la conception de contacts intramoléculaires à longue distance et de motifs de reconnaissance de la N-myristoyltransférase

Description:

La stabilité cinétique est une propriété physique des protéines qui détermine leur durée de vie fonctionnelle. En utilisant les protéines β-trèfle hisactophilin et ThreeFoil, le laboratoire Meiering a déterminé que les contacts intramoléculaires d'acides aminés à longue distance sont un déterminant de la stabilité cinétique. Nous étudions davantage le rôle des contacts à longue distance dans la stabilité cinétique des protéines en concevant et en caractérisant des mutants de ThreeFoil contenant moins de contacts à longue distance que la protéine parente extrêmement stable. De plus, nous concevons les N-terminaux de ces mutants pour accommoder la myristoylation, une modification cotraductionnelle qui a été montrée pour influencer la stabilité cinétique et la cinétique de repliement.

Loisirs:

Aller à la salle de sport, cultiver des champignons et diverses autres activités.

Ville Natale:

Ottawa, Ontario, Canada

Gary Zheng

Candidat à la maîtrise
Département de chimie
Université de Toronto

Superviseur:

Dr. Andrew Woolley

Projet:

Conception d'inhibiteurs affibody activables par la lumière

Description:

Les développements thérapeutiques autour de nombreux réseaux de signalisation protéique cliniquement pertinents sont actuellement freinés par la caractérisation incomplète de leurs interactions. Mon projet porte sur l'ingénierie d'inhibiteurs sélectifs affibody activables par la lumière ciblant les interactions clés au sein de ces réseaux complexes. En créant des outils qui peuvent inhiber dynamiquement et de manière réversible la signalisation protéique, je vise à permettre des descriptions de la dynamique spatiotemporelle dans les réseaux de signalisation protéique complexes, ce qui informera des approches au niveau des systèmes pour les développements cliniques qui conduiront finalement à de meilleurs résultats thérapeutiques.

Loisirs:

Tennis, lecture et jardinage.

Ville Natale:

Mississauga, Ontario, Canada


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