ÉTUDIANTS
Dr. Corrie daCosta
Approche de reconstruction ancestrale de la structure et de la fonction des récepteurs de l’acétylcholine
Les fonctions des protéines modernes sont le produit de millions d’années d’évolution. À l’aide de la reconstruction d’une protéine ancestrale, mon projet retrace cette histoire en laboratoire pour comprendre comment l’évolution des acides aminés influe sur la perméabilité aux ions des récepteurs nicotiniques de l’acétylcholine.
Je joue au soccer et au squash et participe à des courses à obstacles (p. ex., les courses Spartan).
Ottawa, Ontario, Canada
Dr. Roberto Chica
Utilisation d’un biocapteur comportant des protéines vertes fluorescentes pour détecter les protéines à expression transitoire
La fusion de protéines vertes fluorescentes (GFP) est utilisée pour identifier et localiser des composantes cellulaires. Par contre, cette stratégie n’explique pas les processus qui se produisent plus rapidement que la demi-vie des chromophores des GFP, qui est de plus de 30 minutes in vivo. Ainsi, le temps de maturation des GFP limite la caractérisation des processus biologiques rapides. Pour remédier à la situation, le groupe Chica a récemment créé un biocapteur protéique à partir d’une GFP mature, mais de faible intensité. Le biocapteur atteint son point de fluorescence le plus intense à la liaison avec une protéine cible fusionnée. Ainsi, notre biocapteur peut servir à détecter des processus biologiques rapides. Une partie du projet se fait en collaboration avec la professeure Katey Rayner (Institut de cardiologie de l’Université d’Ottawa), soit la validation in vivo du biocapteur dans les cellules de mammifères. Nous travaillons aussi sur différentes protéines fluorescentes aux fins de multiplexage.
J’aime les activités familiales comme la baignade, la pêche et la raquette. Je passe du temps au chalet et l’entretiens. Je suis aussi le roi du barbecue et des feux de camp. J’apprécie les activités extérieures en famille et les moments agréables.
Casselman, Ontario, Canada
Dr. Corrie daCosta & Dr. Roberto Chica
Conception de la spécificité des agonistes des récepteurs ionotropes avec l’aide de l’ordinateur
Develop L’objectif est de concevoir des biocapteurs pour n’importe quelle petite molécule cible en modifiant la spécificité des agonistes des récepteurs ionotropes. Pour le réaliser, nous générons par ordinateur des variantes qui se lient à la petite molécule cible. La liaison des agonistes et l’activation des canaux sont ensuite observées à l’aide d’une sonde GCAMP basée sur les cellules. Les canaux réactifs sont caractérisés par électrophysiologie un à la fois, après quoi la séquence d’étapes de conception par ordinateur, examen et caractérisation est répétée plusieurs fois pour optimiser les fonctions du biocapteur.
J’aime analyser des films, faire de la dynamophilie, chanter et essayer de nouveaux aliments.
Ottawa, Ontario, Canada
Dre. Elizabeth Meiering
Définition de la structure des corps d’inclusion par un échange d’amides en milieu saturé
Mon projet de recherche consiste à créer des méthodes de RMN permettant de définir la structure des corps d’inclusion formés de diverses protéines et protéines mutantes associées. En combinant les résultats de la RMN avec les données sur la stabilité et les propriétés biophysiques des variantes naturelles et artificielles, je souhaite obtenir une connaissance prédictive des déterminants moléculaires de la structure particulière de certaines combinaisons de protéines.
Dans mes temps libres, j’aime cuisiner et faire des pâtisseries. Je fais aussi du yoga, et je passe beaucoup de temps à jouer avec mes chats.
Mississauga, Ontario, Canada
Dr. Nicolas Doucet
Rôle du contrôle allostérique et de la communication à l’interface homodimérique dans l’apoptose de la cellule provoquée par la galectine-7
Les galectines peuvent agir à titre de régulateurs de la cellule en liant des motifs de glycane aux récepteurs de la membrane. Ce sont des lectines qui se lient au bêta-galactosyl et qui relient les molécules par leurs groupements sucre, formant un lien physique et une voie de signalement. Une expression accrue de la galectine-7 (Gal-7) a été observée dans de nombreux néoplasmes. Des recherches de notre groupe ont montré que la Gal-7 peut engendrer une résistance à l’apoptose lorsque sa structure homodimère est modifiée. L’objectif de mon projet de recherche est d’étudier le rôle du contrôle allostérique et de la communication à l’interface homodimérique lors de l’apoptose de la cellule provoquée par la Gal-7 en caractérisant le réseau dynamique d’interactions ayant lieu dans la molécule, ce qui nous permettrait de concevoir des Gal-7 mutantes pouvant provoquer l’apoptose de néoplasmes.
J’adore lire et voyager. J’aime les activités extérieures et passer du temps avec mes amis, mais j’aime aussi jouer à des jeux vidéo et écouter des films et des séries.
Toluca, État de Mexico, Mexique
Dr. Robert Campbell
Mise au point d’un indicateur membranaire de tension intégré à l’ADN
La mécanotransduction, soit la conversion d’un signal mécanique en information biochimique, joue un rôle dans une large gamme de processus physiologiques essentiels, y compris le contrôle du cycle cellulaire, la morphogenèse précoce, le fonctionnement du système cardiovasculaire et la métastase. Toutefois, on en sait très peu sur la mécanotransduction à l’échelle cellulaire. Mon projet vise la mise au point d’un capteur de signal mécanique pour faciliter l’étude de la mécanotransduction et de la biophysique de la membrane. Nous entendons utiliser la sensibilité mécanique intrinsèque des canaux ioniques mécanosensibles, et intégrer la capacité à détecter la tension à des capteurs membranaires de tension fluorescents intégrés à l’ADN grâce à une combinaison de techniques, dont la biologie moléculaire, les tests sur les cellules et la simulation de dynamique moléculaire.
Lorsque je ne travaille pas à mes recherches, j’aime essayer de nouvelles recettes et faire de la photo.
Qingdao, Shandong, Chine
Dr. Andrew Woolley
Outils optiques pour le contrôle spatiotemporel multiplexe de l’expression des gènes grâce à CRISPR-Cas9
Les fonctions de base de la cellule, essentielles à la vie, sont le résultat d’un protéome régulé dans le temps et dans l’espace par la transcription et la traduction. La différenciation et la dédifférenciation des cellules souches et, par extension, la régénération et la fonction des neurones, des tissus et des organes sont autant de phénomènes d’intérêt où le contrôle externe de l’expression d’un gène (et de l’activité d’une protéine) habituellement gouvernée par différents régulateurs endogènes pourrait permettre un contrôle précis de la fonction et de la destinée de la cellule. La conception d’outils optogénétiques orthogonaux répondant à un stimulus externe non effractif, en l’occurrence la lumière, stimulus le plus accessible et le plus facile à contrôler, permettrait un réel contrôle multiplexe de l’expression des gènes. La phosphodiestérase spécifique au GMP cyclique, l’adénylate-cyclase et Fh1A (facteur d’induction de l’interféron gamma), des capteurs de lumière naturels chez les plantes et les bactéries, seront utilisés comme base pour une nouvelle gamme d’outils optogénétiques améliorés compatibles avec une version inactivée de CRISPR-Cas9.
Aquariophile amateur, j’aime le jardinage, l’artisanat et la lecture.